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MeRIP-Seq/m6A-Seq整體服務全面升級

從m6A-IP、建庫測序分析及MeRIP-qPCR一站式服務
高成功率的ng級建庫
一網打盡mRNA、長鏈非編碼RNA

銳博生物提供的MeRIP-Seq(Methylated RNA Immunoprecipitation Sequencing)利用單克隆抗體抓取存在m6A修飾的RNA片段,結合高通量測序,實現轉錄組學范圍內的m6A peak檢測與motif分析,覆蓋從m6A-IP、建庫測序分析及MeRIP-qPCR一站式服務。

銳博優勢技術特色

1、平臺完整: MeRIP實驗—建庫測序分析—MeRIP qPCR驗證,真正一站式服務
2、高成功率:成功開展超過1000例樣本,支持低至ng級別RNA建庫
3、靈活選擇:建庫方式和文庫片段大小可選
4、重復性好:豐富的項目經驗確保實驗重復性,已進行多樣本間的比較分析

項目樣品準備

1、組織:建議>3g,部分RNA量少的組織可能需更多的組織。
2、細胞:建議> 2×107,部分RNA量少的細胞可能需更多的細胞。
3、total RNA:建議>100 μg。

推薦測序模式及數據量

illumina SE50,20M clean reads
illumina PE150,6G clean data

研究思路

illumina SE50,20M clean reads
illumina PE150,6G clean data

結合峰分析

motif檢測

詳細分析報告模板請與銷售代表聯系!

如何委托以上MeRIP-seq(m6A)整體服務?

請登陸銳博生物官網www.yimtwu.icu,花3分鐘注冊一個賬戶,即可在線委托MeRIP-seq整體服務啦~~~

1、賬戶注冊審核通過后,只需點擊以下鏈接:http://www.yimtwu.icu/our-services/,進入銳博官網委托技術服務頁面。
2、選擇需要委托的服務項目,如MeRIP-seq,則點擊進入高通量測序模塊。
3、填寫需求信息并提交,選擇需要委托的測序服務類型MeRIP-seq,并填寫樣本等信息,直接提交成功。

關于m6A研究背景

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m6A修飾普遍存在于mRNA 和多種類型的非編碼RNA,通過影響RNA加工成熟、穩定性、mRNA運輸與翻譯、RNA編輯等方面,參與腫瘤發生和轉移、胚胎發育、DNA損傷修復和病毒感染等生物學功能和作用機制的研究。相對于研究較早的DNA和組蛋白表觀修飾,近年來發現,RNA上也存在類似的調控機制。RNA修飾超過150種,N6-methyladenosine (m6A)作為最常見的轉錄后修飾,介導了超過80%的RNA堿基甲基化。這種甲基化修飾非常普遍,其功能由“編碼器Writer”、“消碼器Eraser”和“讀碼器Reader”介導。

RNA N6‐methyladenosine methyltransferase‐like 3 promotes liver cancer progression through YTHDF2‐dependent posttranscriptional silencing of SOCS2[J].?Hepatology, 2018, 67(6):2254.

Writer即甲基轉移酶,在體內和體外催化RNA發生m6A甲基化修飾,包括METTL3、METTL14和WTAP,VIRMA和RBM15可能也算上。Erasers即去甲基化酶,將RNA甲基化修飾信號擦除,包括ALKBH5和FTO。Readers即可識別RNA甲基化修飾的讀碼器,會參與后續的RNA翻譯、穩定性、剪切和轉運等過程,包括含YTH結構域的YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、YTHDC1和YTHDC2。

研究切入點

1、Cui Q, Shi H, Ye P, et al.在細胞內敲低甲基轉移酶METTL3和METTL14蛋白的表達,可以誘導 GSCs內原癌基因的表達,促進GSCs的生長、自我更新和分化。
2、Ma J Z, Yang F, Zhou C C, et al. METTL14通過調控pri-miRNA的m6A修飾,影響miR-126的生成加工,從而抑制肝癌的轉移。
3、Li Z, Weng H, Su R,et al. FTO作為第一個被發現的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結合能力,進而調控pre-mRNA的剪切加工過程。
4、Zhao B S, Wang X, Beadell A V, et al. YTHDF2可以識別修飾后的mRNA,并介導m6A依賴的RNA降解過程。
5、Yang X, Laurent B, Hsu C H, et al.由甲基轉移酶METTL3和去甲基化酶FTO共同調控的RNA m6A甲基化修飾,會指導Pol κ在DNA損傷位點聚集,促進損傷的修復,
6、Yang Y, Fan X, Mao M, et al. m6A識別蛋白YTHDF3能夠結合到環狀RNA的修飾位點并募集eIF4G2和其他翻譯起始因子來驅動環狀RNA的翻譯。
仍待探索多種可能… …

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